Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptprz1B9EKR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptprz1B9EKR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptprz1B9EKR1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptprz1B9EKR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptprz1B9EKR1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptprz1B9EKR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptprz1B9EKR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms