Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfia1B2RXQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppfia1B2RXQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ppfia1B2RXQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppfia1B2RXQ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfia1B2RXQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfia1B2RXQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfia1B2RXQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppfia1B2RXQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfia1B2RXQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfia1B2RXQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfia1B2RXQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms