Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc22a28B2RT89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc22a28B2RT89 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc22a28B2RT89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc22a28B2RT89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a28B2RT89 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a28B2RT89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms