Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ythdc2B2RR83 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ythdc2B2RR83 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ythdc2B2RR83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Ythdc2B2RR83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ythdc2B2RR83 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ythdc2B2RR83 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ythdc2B2RR83 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Ythdc2B2RR83 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Ythdc2B2RR83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ythdc2B2RR83 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms