Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf3B2RQG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf3B2RQG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phf3B2RQG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Phf3B2RQG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms