Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Plekhd1B2RPU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Plekhd1B2RPU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Plekhd1B2RPU2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plekhd1B2RPU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Plekhd1B2RPU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Plekhd1B2RPU2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Plekhd1B2RPU2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plekhd1B2RPU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Plekhd1B2RPU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Plekhd1B2RPU2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Plekhd1B2RPU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms