Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tex28B1AYN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tex28B1AYN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tex28B1AYN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tex28B1AYN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tex28B1AYN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tex28B1AYN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms