Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spocd1B1ASB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spocd1B1ASB6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spocd1B1ASB6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Spocd1B1ASB6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spocd1B1ASB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms