Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll11A4Q9F4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll11A4Q9F4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttll11A4Q9F4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll11A4Q9F4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttll11A4Q9F4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttll11A4Q9F4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms