Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc38A3KMP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc38A3KMP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc38A3KMP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc38A3KMP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc38A3KMP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc38A3KMP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc38A3KMP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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