Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6880A3KG45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6880A3KG45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6880A3KG45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6880A3KG45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6880A3KG45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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