Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fibcd1A2AV25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fibcd1A2AV25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fibcd1A2AV25 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fibcd1A2AV25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fibcd1A2AV25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms