Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd7A2AJK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd7A2AJK6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd7A2AJK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Chd7A2AJK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chd7A2AJK6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd7A2AJK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms