Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc163A2AGD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc163A2AGD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc163A2AGD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc163A2AGD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms