Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms