Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms