Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms