Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms