Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRU1

CN725425, cDNA sequence CN725425, mousemouse

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CN725425A0A087WRU1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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CN725425A0A087WRU1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CN725425A0A087WRU1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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CN725425A0A087WRU1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CN725425A0A087WRU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CN725425A0A087WRU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CN725425A0A087WRU1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CN725425A0A087WRU1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CN725425A0A087WRU1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CN725425A0A087WRU1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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CN725425A0A087WRU1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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CN725425A0A087WRU1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CN725425A0A087WRU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms