Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm28360A0A087WR25 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28360A0A087WR25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28360A0A087WR25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm28360A0A087WR25 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm28360A0A087WR25 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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