Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms