Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms