Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a5Q5RJI2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms