Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MitfQ08874 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MitfQ08874 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms