Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhoP15409 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhoP15409 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhoP15409 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhoP15409 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms