Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms