Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smco4Q9JIS3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smco4Q9JIS3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms