Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms