Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Knl1Q66JQ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms