Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arcn1Q5XJY5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Arcn1Q5XJY5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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