Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms