Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacs2Q3V3Q7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms