Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sdr16c6Q05A13 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms