Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prf1P10820 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prf1P10820 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prf1P10820 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms