Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt71Q9R0H5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt71Q9R0H5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms