Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms