Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx6Q9ER75 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx6Q9ER75 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms