Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TmieQ8K467 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TmieQ8K467 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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TmieQ8K467 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TmieQ8K467 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TmieQ8K467 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TmieQ8K467 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TmieQ8K467 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TmieQ8K467 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.3 ms