Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rassf9Q8K342 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms