Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Knl1Q66JQ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Knl1Q66JQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms