Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms