Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc44a5Q5RJI2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms