Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam228bQ497Q6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms