Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms