Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psme1P97371 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psme1P97371 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psme1P97371 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms