Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.2 ms