Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Efna3O08545 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms