Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700019A02RikA0A087WPV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms