Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssxb10Q6XAR7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ssxb10Q6XAR7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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