Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdc1Q5PSV9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.1 ms