Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Uspl1Q3ULM6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Uspl1Q3ULM6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uspl1Q3ULM6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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